Night Head 2041 es una serie anime que sigue la historia de los hermanos Kirhara que, desde muy jóvenes, fueron encarcelados en una instalación científica debido al surgimiento de sus poderes sobrenaturales. Pero éstos consiguen escapar tras sobrepasar la barrera que les impedía usar sus poderes. Tras ellos se encuentran los hermanos Kuroki que intentarán atraparlos a toda costa.