Takamachi Nanoha, estudiante de tercer grado, tropezó con un hurón que hablaba lesionado después de escuchar sus gritos telepáticos de ayuda. El hurón resultó ser Yuuno, un arqueólogo y mago de otro mundo que había dispersado accidentalmente las peligrosas Semillas de Joyas por toda la Tierra. Sin la fuerza para recolectar los Jewel Seeds, Yuuno había recuperado la forma de un hurón y necesitaba que alguien más asumiera la tarea por él. Le dio una joya roja a Nanoha y le explicó que con ella podía transformar y usar la magia para combatir a los monstruos que los amenazaban debido a los Jewel Seeds. Pero los monstruos son la menor de sus preocupaciones, ya que Yuuno y Nanoha no son los únicos que recogen las Semillas de Joyas.