Siete años después de que la humanidad fuera devastada por un gran desastre, un faro de ciencia y prosperidad se alza en la ciudad de Kamitsubaki. Pero acechando en sus sombras se encuentran los Tesseractor, monstruos nacidos de la oscuridad humana. Solo las Witchling, cinco chicas con voces que ejercen magia, se les oponen. Con cada nota, luchan, no solo para proteger la paz de la ciudad, sino para sanar un mundo destrozado.